| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link |
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| 2018 | 1657年尋金日誌的歷史學註釋 | 翁佳音 | ||||
| 2021 | 「Hoanya」族名辯證及其周遭族群 | 翁佳音 ; 曹銘宗 | 臺灣史研究 第28卷第4期，頁1-40 | |||
| 2010 | Hoanya考辨 | 翁佳音 | ||||
| 2007 | 三八查某舉雨傘：傘的社會文化史 | 翁佳音 | 歷史月刊, 4: 24-31 | |||
| 2013 | 不是人就是狗 | 翁佳音 | 國立臺灣歷史博物館 《觀●臺灣》 季刊 ※ 趣談臺灣人專欄, 18，18-19 | |||
| 2003 | 世變下的早期臺灣原住民 | 翁佳音 | 福爾摩沙─十七世紀的臺灣、荷蘭與東亞 (臺北：故宮博物院)，頁105-124 | |||
| 2003 | 世變下的早期臺灣原住民 | 翁佳音 | 福爾摩沙 —十七世紀的臺灣、荷蘭與東亞 (台北 : 故宮博物院) | |||
| 2003 | 人神湊熱鬧？媽祖與鄭成功信仰的「新」論 | 翁佳音 | 第五屆中國近代文化的解構與重建學術研討會論文集，頁261-278 | |||
| 2003 | 人神湊熱鬧？媽祖與鄭成功信仰的「新」論 | 翁佳音 | ||||
| 2003 | 他們說什麼話？近代初期東亞世界的交通語（lingua franca） | 翁佳音 | ||||
| 2005 | 似曾相似：荷鄭時代漢系臺灣人的國族認同 | 翁佳音 | ||||
| 2012 | 你是哪裡人? | 翁佳音 | 國立臺灣歷史博物館 《觀●臺灣》 季刊 ※ 趣談臺灣人專欄, 13，50-51 | |||
| 2012 | 像女王的排灣族好婦人 | 翁佳音 | 原住民族文獻, 第1輯第1期，頁36-37 | |||
| 2015 | 初次噍吧哖事件──文獻再解析的必要 | 翁佳音 | 原住民族文獻 22期，頁218-224 | |||
| 2005 | 十七世紀東亞大海商亨萬（Hambuan）事蹟初考 | 翁佳音 | 故宮學術季刊 第22卷第4期，頁83-102 | |||
| 2007 | 十七世紀臺江內海一帶的產業、社會發展 | 翁佳音 | ||||
| 2017 | 古典百科通史依然必要(導讀) | 翁佳音 | 福爾摩沙詳盡的地理與歷史, XI一XVI | |||
| 2008 | 台南姑娘「娶」荷蘭台灣長官 | 翁佳音 | 歷史月刊, 245,55 | |||
| 2021 | 吃的台灣史：荷蘭傳教士的麵包、清人的鮭魚罐頭、日治的牛肉吃法，尋找台灣的飲食文化史 | 翁佳音 ; 曹銘宗 | 台北市 | |||
| 2008 | 嘉義地區的潮州人後裔 | 翁佳音 |
