| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link |
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| 2003 | 台灣北部地區生物資源調查：維管束植物（台北地區） | 彭鏡毅; 劉建華; 梁慧舟; 翁茂倫 | 台灣生物資源調查與研究研討會論文集。行政院農委會，國立中山大學生物科學系出版 118-127 | |||
| 2005 | 台灣十字花科的新歸化植物—南美獨行菜 | 許再文; 蔣鎮宇; 彭鏡毅 | 特有生物研究 7, 89-94 | |||
| 2004 | 台灣新歸化菊科 (Asteraceae) 裸穗豬草 | 曾彥學; 彭鏡毅 | 特有生物研究 6, 71-74 | |||
| 2010 | 台灣物種名錄 | 邵廣昭 ; 彭鏡毅; 吳文哲 | 台灣 | |||
| 2002 | 國內植物資料庫之整合與發展 | 彭鏡毅; 穆家宏 | 博物館典藏數位再造理論與實務研討會－人與自然論文集。數位典藏國家型科技計畫內容發展分項計畫出版。 85-90 | |||
| 2004 | 發現台灣植物 | 彭鏡毅 | 中央研究院植物研究所、生物多樣性研究中心出版 v.1-v.6, 每冊各35頁 | |||
| 2003 | 鴛鴦湖自然保留區常見植物解說手冊(一) | 彭鏡毅; 呂文賓 | 行政院退輔會榮民森林保育事業發展處，中央研究院植物研究所出版 155頁 |
