| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link |
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| 2007 | 03.知識饗宴系列03電子書 | 廖弘源; 鄭錦全; 許聞廉; 范毅軍; 張亞中; 陶雨臺; 陳仲瑄; 楊寧蓀; 江博明; 鄭明修; 王明珂 ; 湯德宗 | 台北市 | |||
| 1987 | 台灣南灣海域尖枝列孔珊瑚 Seriatopora hystrix 共棲的槍蝦 | 鄭明修; 張崑雄 | 海洋科學研討會，論文摘要集 | |||
| 1999 | 台灣東北角海兔的分類與族群生態研究 | 林昕佑; 鄭明修 | 台灣水產學會學術論文發表會，論文摘要集 | |||
| 2003 | 台灣河川生態工法下之水生動物多樣性現況 | 鄭明修 | 應用生態工法保育生物多樣性研討會論文集中華民國溪流環境協會 | |||
| 2004 | 台灣海岸生態環境的危機與轉機 | 鄭明修 | 邁向美麗的自然海岸—漁港與海岸保護方法論壇 13-17 | |||
| 1997 | 台灣珊瑚礁海域產經濟性無脊椎動物資源的利用與保育 | 鄭明修 | 台灣省水產學會，論文摘要集 | |||
| 2003 | 台灣綠島海洋生態保育與觀光永續發展策略 | 鄭明修 | 台琉論壇，第4回，日本沖繩 31-48 | |||
| 1996 | 墾丁國家公園甲殼十足類生物相及其生態保育 | 鄭明修; 游祥平 | 第四屆珊瑚礁生物研討會，論文集 | |||
| 1995 | 大管蛇螺(Dendropoma maximum)在珊瑚礁上族群結構之研究 | 鄭明修 | 第三屆珊瑚礁生物研討會，論文摘要集 | |||
| 1994 | 尖枝列孔珊瑚及其共棲生物生態 | 鄭明修 | 第二屆珊瑚礁生物研討會，論文摘要集 | |||
| 2000 | 底棲無脊椎動物群聚 | 邵廣昭; 張文亮; 邱文良; 謝蕙蓮; 巫文隆; 鄭明修; 馬堪津; 劉小如; 吳海音; 李培芬; 林幸助 | 關渡自然保留區及關渡自然公園環境監測與研究,343 | |||
| 2001 | 淡水河口蝦蟹類群聚變動之研究 | 鄭明修; 林昕佑; 陳登松 | 第二屆河口、潟湖生態與環境研討會，論文摘要集 | |||
| 2002 | 淡水河河口生態監測系統的建立 | 邵廣昭; 李信徹; 馬堪津; 陳章波; 詹榮桂; 劉小如; 鄭明修; 謝蕙蓮; 吳俊宗; 邱志郁 | 中央研究院,298pp | |||
| 2000 | 「淡水河生態監測系統的建立(II)」 | 邵廣昭; 吳俊宗; 李信徹; 馬堪津; 陳章波; 詹榮桂; 劉小如; 鄭明修; 謝蕙蓮; 邱志郁 | 中央研究院研究報告,1月18日 | |||
| 2001 | 「淡水河生態監測系統的建立(III)」 | 邵廣昭; 吳俊宗; 李信徹; 馬堪津; 陳章波; 詹榮桂; 劉小如; 鄭明修; 謝蕙蓮; 邱志郁 | 中央研究院研究報告,298 | |||
| 1999 | 「淡水河生態監測系統的建立」 | 邵廣昭; 李信徹; 馬堪津; 陳章波; 詹榮桂; 劉小如; 鄭明修; 謝蕙蓮; 吳俊宗; 邱志郁 | 中央研究院研究報告,1月29日 | |||
| 2000 | 潛水休閒漁業與珊瑚礁生態保育休閒漁業研討會專題演講 | 鄭明修 | 國立中山大學海洋科學院漁業推廣委員會 59-66 | |||
| 1992 | 澎湖海洋動物生態資源利用及保育 | 鄭明修 | 澎湖海洋漁業生態資源利用及保育研討會論文集 37pp | |||
| 2004 | 綠島珊瑚礁生態系之變遷 | 鄭明修 | 海洋保護區劃設、經營管理研討會論文集 37-45 | |||
| 2001 | 脈結指形軟珊瑚(Sinularia gibberosa骨針之形成與膠結之顯微研究 | 蕭伊真; 鄭明修; 戴昌鳳 | 第九屆珊瑚礁生物研討會，論文摘要集 |
