本所之籌設，源自民國七十七年院士會議決議成立中國文哲研究所，報呈總統府核准設籌備處，推展設所事宜。後於九十一年七月一日正式成所。本所研究取向分為文學、哲學、經學三方面。成立宗旨在於擷取古往今來中國文化的精髓，以作為當前文化創造的活水源頭，為舊傳統注入新聲，為新文化深化內涵。同時，利用研究人員具有多元的學科背景，開展多元研究觀點，進行科際整合對話，並對研究方法與範疇，持續進行創新的嘗試與深刻的反思。此外，本所積極與國際漢學界溝通對話，匯通海內外研究成果，打造國際交流平台。
