中央研究院資訊科學研究所於1977年設立籌備處，1982年9月正式成立研究所。
本所依研究領域共有生物資訊實驗室、電腦系統實驗室、資料處理與探勘實驗室、多媒體技術實驗室、語言與知識處理實驗室、網路系統與服務實驗室、程式語言與形式方法實驗室、計算理論與演算法實驗室等八大實驗室，研究重點包含生物資訊、平行及分 散式運算、智慧代理人、文件分析與辨識、多媒體系統、電腦視覺、影像處理及圖形識別、中文資訊處理、自然語言理解、電腦通訊與網路、網路內容管理與XML、網路與軟體安全、形式驗證、演算法設計與分析、密碼學、機器人學等。除從事資訊科學領域基礎研究，亦以開發具前瞻性之尖端技術與發展以應用為導向的最先進系統為職志。
