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| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link | |
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| 1 | 2010 | 馬祖列島的史前聚落 | 陳仲玉 | 海洋遺產與考古，頁39-47 (科學出版社) | |||
| 2 | 2013 | 馬祖亮島島尾遺址群發掘及『亮島人』修復計畫 | 陳仲玉 ; 邱鴻霖; 游桂香; 尹意智; 林芳儀 | 連江縣 | |||
| 3 | 1996 | 金門地區透地雷達探測貝塚 | 陳仲玉 ; 董倫道 | 第四屆科學史研討會彙刊，頁269-275 (台北：中央研究院科學史委員會) | |||
| 4 | 2005 | 金門史前時代的文化 | 陳仲玉 | 金門歷史、文化與生態國際學術研討會論文集，頁1-19 (財團法人施合鄭民俗文化基金會) | |||
| 5 | 2004 | 論臺灣高山地區的史前聚落 | 陳仲玉 | 桃李成蹊集—慶祝安志敏先生八十壽辰，頁266-271 (香港 : 香港中文大學中國考古藝術研究中心) | |||
| 6 | 2012 | 論海灣三角洲與海洋文明－以杭州灣三角洲為例 | 陳仲玉 | 跨湖橋文化學術研討會論文集 (北京 : 文物出版社) | |||
| 7 | 2002 | 論中國考古學海洋島嶼的研究取向--以殷商文化的海洋成分為例 | 陳仲玉 | 石璋如院士百歲祝壽論文集，頁209-225 (台北 : 南天書局) | |||
| 8 | 2011 | 談馬祖列島的『曲蹄』族 | 陳仲玉 | 2011馬祖研究：馬祖列島與海洋環境文化 (連江縣南竿鄉 : 連江縣政府) | |||
| 9 | 2002 | 試論中國東南沿海的海洋族群 | 陳仲玉 | 海峽兩岸河姆渡文化學術研討會論文集 (北京 : 海洋出版社) | |||
| 10 | 1995 | 蘭嶼史前文化初探 | 陳仲玉 | 慶祝建館八十周年論文集，頁667-715 (台北：國立中央圖書館臺灣分館) | |||
| 11 | 1998 | 臺灣史前的玉器工業 | 陳仲玉 | 東亞玉器—慶祝中國考古藝術研究中心創立二十周年論文集 Vol. I (香港中文大學中國考古藝術研究中心)，頁336-349 | |||
| 12 | 1991 | 美國歷史古蹟維護政策 | 陳仲玉 | 考古與歷史文化：慶祝高去尋先生八十大壽論文集(上)，頁277-309 (台北：正中書局) | |||
| 13 | 1999 | 福建金門金龜山與浦邊史前遺址 | 陳仲玉 | 東南考古研究 第二輯，頁52-61(廈門大學出版社) | |||
| 14 | 1984 | 玉山國家公園預定地區人文史蹟調查 | 陳仲玉 ; 曾振名 | 台北市 | |||
| 15 | 1995 | 清代漢人拓殖埔里盆地與「眉番」所引起的族群變遷 | 陳仲玉 | 第一屆臺灣本土文化學術研討會論文集，頁637-649 (台北：國立臺灣師範大學文學院、人文教育研究中心) | |||
| 16 | 2001 | 泰國的歷史與文化英文書目彙編 (A bibliography for the history and culture of Thailand) | 陳仲玉 | Taipei | |||
| 17 | 2002 | 泰南四府中國人的神廟與善堂 | 陳仲玉 | 瓊粵地方文獻國際學術研討會論文集，頁347-364 (海口：海南大學出版社) | |||
| 18 | 1994 | 曲冰 (中央研究院歷史語言研究所田野工作報告之二) | 陳仲玉 | 台北市 | |||
| 19 | 1986 | 太魯閣國家公園人文史蹟調查 | 陳仲玉 ; 邱敏勇; 楊淑玲 | 台北市 | |||
| 20 | 1998 | 史語所遷南港的第一倉庫 | 陳仲玉 | 新學術之路：中央研究院歷史語言研究所七十周年紀念文集下冊，頁1009-1014 (台北 : 中央研究院歷史語言研究所) | |||
| 21 | 1994 | 台灣與南海區域考古學相關研究的展望 | 陳仲玉 | 兩岸及海外華人南海學術研討會論文集，頁49-54 (台北：中國國際法學會) | |||
| 22 | 2000 | 台灣考古學的回顧與前瞻 | 陳仲玉 | 中國考古學跨世紀的回顧與前瞻：1999年西陵國際學術研討會論文集 (北京：科學出版社) | |||
| 23 | 1997 | 古代土城的居民 | 陳仲玉 | 擺接風華土城情，頁1-5 (台北縣：土城市公所) | |||
| 24 | 2008 | 南中國海諸島上的碑碣 | 陳仲玉 | 慶祝何炳棣先生九十華誕論文集，頁668-678 (西安 : 三秦出版社) | |||
| 25 | 2012 | 以考古學重建「馬祖列島」的歷史 | 陳仲玉 | 文化馬祖（2011馬祖文化年鑑）(連江縣 : 連江縣政府文化局) | |||
| 26 | 2013 | 亮島人DNA研究 | 陳仲玉 | 連江縣 | |||
| 27 | 1996 | 中國南海地區考古學研究相關書目 | 陳仲玉主編 | 台北 | |||
| 28 | 1996 | 中國南海區域考古學研究相關資料的四個範疇 | 陳仲玉 | 海南暨南海學術研討會論文集，頁531-548 (台北：國立中央圖書館臺灣分館) | |||
| 29 | 1992 | A Prehistoric Settlement in the Mountains of Central Taiwan－and Discussion of the Origin of Mountainous Settlements | Chung-Yu Chen | 陳奇祿院士七秩榮慶論文集，頁451-463 (台北：陳奇祿院士七秩榮慶論文集編輯委員會) | |||
| 30 | 2015 | 03.知識饗宴系列11電子書 | 李羅權; 陳錦地 ; 廖弘源; 李小媛; 吳金洌; 陳昭倫; 蔡宜芳; 楊建成; 陳仲玉 ; 沙培德 ; 張珣 | 台北市 |
