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| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link | |
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| 1 | 2005 | 馬祖東莒熾坪隴史前遺址第二期研究報告 | 陳仲玉 ; 王花俤等 | 馬祖民俗文物館 | |||
| 2 | 2004 | 馬祖東莒熾坪隴史前遺址的研究 | 陳仲玉 ; 王花俤等 | 馬祖民俗文物館 | |||
| 3 | 2007 | 馬祖地區考古遺址田野調查與研究計畫 | 陳仲玉 ; 王花俤等 | 馬祖民俗文物館 | |||
| 4 | 2013 | 馬祖亮島島尾遺址群發掘及『亮島人』修復計畫 | 陳仲玉 ; 邱鴻霖; 游桂香; 尹意智; 林芳儀 | 連江縣政府文化局 | |||
| 5 | 2012 | 馬祖亮島島尾遺址第一期研究［期末報告］ | 陳仲玉 ; 邱鴻霖; 游桂香; 尹意智; 林芳儀 | 連江縣政府文化局 | |||
| 6 | 2006 | 馬偕醫學院校地歷史古蹟監測報告 | 陳仲玉 | 財團法人台灣基督長老教會馬偕紀念社會事業基金會 | |||
| 7 | 2000 | 集集共同引水計畫工區內共和遺址搶救發掘及鄰近地區施工監測報告 | 陳仲玉 ; 劉益昌等 | 經濟部水利處中區水資源工程局 | |||
| 8 | 1998 | 陽明山國家公園大屯山區遺址之研究 | 陳仲玉 | 陽明山國家公園管理處 | |||
| 9 | 1987 | 陽明山國家公園人文史蹟調查 | 陳仲玉等 | 內政部營建署陽明山國家公園管理處 | |||
| 10 | 1994 | 關西機械科技專業區開發工程計畫文化遺址影響評估案 | 陳仲玉 ; 陳維鈞 | 新環工程顧問股份有限公司 | |||
| 11 | 1997 | 金門島考古遺址調查研究 | 陳仲玉 ; 董倫道; 黃信凱 | 金門國家公園管理處 | |||
| 12 | 1995 | 金門地區考古遺址初步調查（一） | 陳仲玉 ; 董倫道 | 內政部營建署 | |||
| 13 | 1989 | 蘭嶼考古學初步調查 | 陳仲玉 ; 楊淑玲; 高韻華 | 內政部營建署 | |||
| 14 | 2004 | 臺閩地區考古遺址普查（七）－南投縣 | 劉益昌; 陳仲玉 ; 郭素秋 | 內政部,500p. | |||
| 15 | 1999 | 能丹國家公園設立可行性評估－人文史蹟部分 | 陳仲玉 ; 趙金勇 | 內政部, 20 p. | |||
| 16 | 1984 | 美濃水庫計劃地區史蹟調查 | 陳仲玉 | 財團法人中華顧問工程公司 | |||
| 17 | 1993 | 私立青雲老人安養中心用地史蹟調查報告 | 陳仲玉 | 私立青雲老人安養中心籌備處 | |||
| 18 | 2002 | 石璋如先生訪問紀錄 | 陳存恭; 陳仲玉 ; 任育德訪問; 任育德紀錄 | 台北市 : 中央研究院近代史研究所 | |||
| 19 | 1984 | 瑪家水庫計劃地區人文史蹟調查報告 | 陳仲玉 ; 宋光宇; 劉益昌 | 財團法人中華顧問工程司 | |||
| 20 | 1994 | 玉里長濱公路新建計劃環境影響說明書文化遺址調查評估工作（補充調查報告） | 陳仲玉 ; 陳維鈞 | 中央研究院歷史語言研究所 | |||
| 21 | 1993 | 玉里長濱公路新建計劃環境影響說明書文化遺址調查評估工作(期末報告) | 陳仲玉 ; 陳維鈞 | 交通部臺灣區國道新建工程局、中鼎工程顧問公司, 12 p. | |||
| 22 | 1982 | 玉山國家公園預定地區人文史蹟調查 | 陳仲玉 ; 曾振名 | 內政部營建署 | |||
| 23 | 1995 | 東沙島南沙太平島考古學初步調查 (地政叢書第二十九輯) | 陳仲玉 | 內政部 | |||
| 24 | 1993 | 曲冰遺址維護規劃案 | 陳仲玉 | 南投縣政府 | |||
| 25 | 2012 | 曲冰史前遺址群研究計畫成果報告 | 趙金勇 ; 陳仲玉 ; 鍾亦興 | 南投縣政府文化局, 132 p. | |||
| 26 | 1990 | 布洛灣泰雅族文化展示館規劃 | 陳仲玉 | 內政部營建署太魯閣國家公園管理處 | |||
| 27 | 1986 | 太魯閣國家公園人文史蹟調查 | 陳仲玉等 | 內政部營建署太魯閣國家公園管理處委託 | |||
| 28 | 1994 | 台閩地區考古遺址普查研究計畫第二期研究報告 | 臧振華 ; 陳仲玉 ; 劉益昌; 李匡悌 ; 陳維鈞 ; 陳瑪玲; 李德仁; 劉克竑; 朱正宜 | 內政部, 50 p. | |||
| 29 | 2001 | 台閩地區考古遺址普查研究計劃第六期研究報告 | 陳仲玉 ; 劉益昌等 | 內政部 | |||
| 30 | 1993 | 台閩地區考古遺址普查研究計劃第一期研究報告 | 黃士強; 臧振華 ; 陳仲玉 ; 劉益昌 | 內政部 | |||
| 31 | 1992 | 台灣地區重要考古遺址初步評估第一階段研究報告 | 宋文薰; 尹建中; 黃士強; 連照美; 臧振華 ; 陳仲玉 ; 劉益昌 | 內政部 | |||
| 32 | 1994 | 台北都會區大眾捷運系統土城延伸線文化遺址發掘及初步展示規劃 | 陳仲玉 | 台北市政府捷運工程局 | |||
| 33 | 2014 | 02.知識饗宴「懸崖上的考古－八千歲『亮島人』出土的故事」 | 陳仲玉 |
