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| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link | |
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| 1 | 2015 | 黃旺成先生日記（十四）一九二七年 | 許雪姬主編 ; 許雪姬 ; 林玉茹 ; 李毓嵐; 曾品滄 ; 石婉舜; 陳世榮; 張曉旻; 許時嘉; 陳志豪; 莊勝全; 李鎧楊; 陳芷盈; 蔡思薇; 曾獻緯; 盧泓文; 莊景雅; 王珮蓉; 劉世溫; 林崎惠美共同註解 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 2 | 2017 | 黃旺成先生日記（十八）一九三一年 | 黃旺成著; 許雪姬主編 ; 許雪姬; 羅久蓉; 林玉茹 ; 陳鴻圖; 周惠玲; 曾品滄 ; 李毓嵐; 清水美里; 鄭麗榕; 陳家豪; 曾齡儀; 陳凱雯; 莊勝全; 鄭螢憶; 蘇峯楠; 李鎧揚; 莊濠賓; 徐聖凱; 嚴漢廷; 吳亮衡; 盧泓文; 施淳孝; 許爾雅; 劉世溫; 林崎惠美共同註解 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 3 | 2015 | 黃旺成先生日記（十五）一九二八 | 黃旺成著; 許雪姬編註 ; 許雪姬 ; 林玉茹 ; 李毓嵐; 陳鴻圖; 曾品滄 ; 張曉旻; 黃毓婷; 吳奇浩; 鄭麗榕; 李朝凱; 莊勝全; 蔡思薇; 鄭螢憶; 李鎧揚; 曾獻緯; 施淳孝; 王珮蓉; 劉世溫; 林崎惠美共同註解 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 4 | 2014 | 黃旺成先生日記（十三）一九二六年 | 許雪姬主編 ; 許雪姬 ; 林玉茹 ; 鍾淑敏; 李力庸; 楊麗祝; 李毓嵐; 林蘭芳; 曾品滄 ; 陳文松; 葉碧苓; 林丁國; 張曉旻; 許時嘉; 林欣宜; 李朝凱; 鄭麗榕; 莊勝全; 鄭螢憶; 李鎧揚; 陳芷盈; 曾獻緯; 吳沁昱; 莊景雅; 王佩蓉; 劉世溫; 林崎惠美共同註解 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 5 | 2017 | 黃旺成先生日記（十七）一九三〇年 | 黃旺成著; 許雪姬主編 ; 許雪姬; 林玉茹 ; 鍾淑敏; 陳鴻圖; 高雅俐; 曾品滄 ; 李毓嵐; 周惠玲; 賴郁君; 黃毓婷; 蔡秀美; 陳家豪; 陳淑容; 陳慧先; 莊勝全; 鄭螢憶; 蘇峯楠; 李鎧揚; 李朝凱; 莊濠賓; 盧泓文; 施淳孝; 張惠婷; 許維庭; 郎詠恩; 劉世溫; 林崎惠美共同註解 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 6 | 2008 | 黃旺成先生日記（一）一九一二年 | 許雪姬主編 ; 許雪姬 ; 鍾淑敏; 林玉茹 ; 陳姃湲 ; 陳培豐; 吳叡人; 張季琳 ; 林蘭芳; 曾士榮; 連憲升; 林文凱; 吳美慧; 鄭麗榕; 吳奇浩; 陳慶立; 林崎惠美共同註解 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所、國立中正大學歷史學系 | |||
| 7 | 2018 | 雙城舊事：近代府城與臺北城市生活記憶口述歷史 | 林玉茹訪問 ; 林建廷記錄 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 8 | 2004 | 逐利之風：清代臺灣郊商的多元投資策略 | 林玉茹 | 歷史月刊, 第201期，頁74-82 | |||
| 9 | 2013 | 走讀美東：2012年訪美經驗談 | 林玉茹 | 歷史臺灣 6期, 169-180 | |||
| 10 | 2010 | 臺灣史研究文獻類目，2009 年度 | 黃富三; 林玉茹 ; 洪麗完 ; 賀安娟; 劉士永 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 11 | 2009 | 臺灣史研究文獻類目，2008 年度 | 黃富三; 林玉茹 ; 洪麗完 ; 賀安娟; 劉士永 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 12 | 2011 | 臺拓在東臺灣的開發 | 林玉茹 | 臺灣學通訊 第58期，頁6 | |||
| 13 | 2009 | 臺南縣平埔族古文書集 | 林玉茹 | 台南 : 台南縣政府 | |||
| 14 | 2004 | 臺南縣平埔族古文書集 | 林玉茹 | 文化建設委員會和臺南縣政府文化局委託 | |||
| 15 | 2023 | 臺北大稻埕商業文書：陳源順號（一）（1901-1904） | 林玉茹 | 臺北 : 中央研究院臺史所 | |||
| 16 | 1994 | 綿延不絕的清淨之火：原住民的家用能源 | 林玉茹 | 能源報導, 1994.5期，頁3-5 | |||
| 17 | 1993 | 清代臺灣港口的空間結構 | 林玉茹 | 國立臺灣大學, 歷史學研究所碩士論文, 347頁 | |||
| 18 | 1997 | 清代竹塹地區的在地商人及其活動網絡 | 林玉茹 | 國立臺灣大學, 歷史學研究所博士論文, 328頁 | |||
| 19 | 2010 | 深耕鄉土，邁向國際：南瀛研究的推動和展開 | 林玉茹 | 臺灣學通訊 第39期，頁14-15 | |||
| 20 | 2003 | 水堀頭遺址探勘試掘暨舊麻豆港歷史調查研究報告》共259頁 | 林玉茹 ; 劉益昌 | 文化建設委員會和臺南縣政府文化局委託,259頁p. | |||
| 21 | 2012 | 比較視野下的臺灣商業傳統 | 林玉茹主編 | 臺北 : 中研院臺史所 | |||
| 22 | 1999 | 明鄭至清中葉的臺灣交通（1662-1860） | 林玉茹 | 國立臺灣歷史博物館委託中研院臺灣史研究所「臺灣交通史展覽規劃案」,共74頁p. | |||
| 23 | 2016 | 我年少時的基隆生活記憶:林月淑女士訪問紀錄 | 林玉茹訪問 ; 林建廷紀錄 | 歷史臺灣 卷10，頁199-224 | |||
| 24 | 2013 | 局開新境：臺灣史研究所二十年 | 林玉茹 ; 張隆志 ; 詹素娟 | 局開新境：臺灣史研究所二十年, 120 | |||
| 25 | 2008 | 導讀一：南瀛學國際研究的展開 | 林玉茹 | 南瀛歷史、社會與文化，頁Ⅵ-Ⅹ | |||
| 26 | 2012 | 導論：比較視野下的臺灣商業傳統 | 林玉茹 | 比較視野下的臺灣商業傳統, Ⅷ-ⅩⅩⅡ | |||
| 27 | 2023 | 學海悠遊：黃富三先生訪問紀錄 | 林玉茹 ; 曾品滄 ; 林正慧訪問; 林建廷記錄 | 臺北 : 中央研究院臺灣史研究所 | |||
| 28 | 2013 | 南瀛國際人文社會科學研究中心10週年 | 林玉茹 ; 植野弘子編 | 南瀛國際人文社會科學研究中心10週年 | |||
| 29 | 2010 | 功名與生理之間：開台進士鄭用錫及其家族的經營策略 | 林玉茹 | 臺灣史上重要人物系列，頁110-127 | |||
| 30 | 2008 | 代書筆、商人風：百歲人瑞孫江淮先生訪問記錄 | 林玉茹 ; 王泰升; 曾品滄 | 臺北 : 遠流出版社 | |||
| 31 | 2017 | Institutional Profile: Institute of Taiwan History(ITH), Academia Sinica & A Brief Introduction to Two Special-Themed Panels | Lin, Yuju | Eats News | |||
| 32 | 2019 | 〈1920-1930 年代烈嶼與福建的商船貿易活動：林天助先生訪問紀錄〉，收錄於《臺灣文獻》第70卷第1期，頁212-226 | 林玉茹訪問、紀錄 | 南投 : 國史館臺灣文獻館 |
